Čtyřřetězcové struktury v DNA a RNA

Instituce: Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Fakulta/ústav:
Další údaje o pracovišti: Oddělení Biofyzika nukleových kyselin
Lektoři: Mgr. Zuzana Dvořáková, Ph.D.

Popis:

Úseky DNA bohaté na guaniny nebo cytoziny mají za určitých podmínek tendenci přijímat nekanonické sekundární struktury - guaninové kvadruplexy nebo cytozinové i-motivy. Zajímavé je, že tyto oblasti se nevyskytují v genomu náhodně, ale jsou umístěny spíše v regulačně důležitých oblastech genů a onkogenů a v telomerách. Existují důkazy, že tyto DNA struktury existují v živých buňkách a hrají důležitou roli v biologických procesech, jako je replikace, regulace (onko)genové exprese a správná funkce telomer. Guaninové kvadruplexy mohou také vznikat na jednořetězcové RNA. Zatímco ale DNA kvadruplexy představují vcelku podrobně probádanou oblast, o RNA kvadruplexech, které také hrají důležitou roli v procesech buněčné regulace, se to samé říci nedá. Pomocí metod spektroskopie cirkulárního dichroismu, UV absorpční spektroskopie a polyakrylamidové gelové elektroforézy bude studován vznik a stabilita čtyřřetězcových struktur regulačně důležitých úseků lidského genomu v závislosti na jejich primární struktuře.